临床医学专业学制五年制，旨在培养适应我国医药卫生事业发展需要的德、智、体、美、劳全面发展的，具有良好的职业素养、人文素质，掌握基础医学、临床医学等方面的基本知识、基本理论和基本技能，具有初步的临床医疗、健康宣教、自主学习和终身学习的能力的，能在各级基层医疗卫生保健机构从事安全有效的医疗实践的，能全心全意为人民健康服务的应用型人才。

1991年山西省教育委员会批准我校设置临床医学专科专业，同年9月开始招生，学制为3年，1999年开始招收五年制本科生，2004年临床医学本科专业通过山西省教育厅学士学位授予资格合格评估及专业合格评估，2006年山西省教育厅和山西医科大学专家组对汾阳学院进行了本科教学工作水平评估，总体评价为“良”。临床医学专业全国24个省份招生，已培养本科毕业生6千余名，目前有硕士、本科两个层次，近三年考研录取率约39%，就业率95%。

临床医学专业3个省级医学重点学科、1个省级医学重点建设学科、3个省市共建医学重点学科、5个省级重点临床专科、6个市级重点学科。内科学、外科学、妇产科学、神经内科学、感染疾病学、耳鼻咽喉科学均可招收硕士研究生。博士生导师1名，硕士生导师22名。现有专任教师122人，其中：具有博士学位10人（8.1%），正高级职称26人（21.3%），副高级职称 59人（48.3%）。山西省卫计委百千万卫生人才工程高端领军人物2人、三晋骨干精英人才16人、五一劳动奖章1人。

学校直属附属医院山西省汾阳医院是三级甲等综合医院，山西首批住院医师规培基地、全科医师培训基地、4个区域医疗中心之一，荣获“建国60周年中国综合实力百强医院”、“山西省十佳医院”等荣誉。附属孝义市中心医院为三级综合医院，教学水平和综合实力等在省内县市级医院中名列前茅。

近年来，临床医学专业以“厚基础、重实践、强技能”为专业培养理念，以培养具备初步临床能力、终身学习能力和创新能力、具备良好人文素养与职业道德、面向基层的应用型人才为目标，不断深化教育教学改革，人才培养质量得到稳步提升。